鱼类的蛋白质含量在14%~18%之间，深海鱼并不比普通淡水鱼高。然而，鱼肉的脂肪和水分含量差异很大。无脂海鱼如黑线鳕和鳕鱼的脂肪含量只有0.1%~0.4%，而富脂海鱼如鳗鱼、鲱鱼和金枪鱼的含脂量高达16%~26%。多数鱼的脂肪含量介于这两者之间。海鱼的脂肪富含ω-3长链不饱和脂肪酸，对降低血脂有益。与淡水鱼相比，海鱼的碘、硒、锰等微量元素含量高，鱼肉当中的维生素A、D的含量也比较高。然而，一些淡水鱼具有特殊的营养保健价值，如黄鳝富含维生素B2,鲤鱼有利水、消肿及通乳的效果。
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